Az endometriózis van, hogy nem csak fájdalmat, hanem meddőséget is okoz. Mégis, sokan félnek a lombikkezeléstől, pedig a lombikbébi program kifejezetten hatékony meddőségi kezelés az endometriózisban.
Egyrészt azért, mert a lombikeljárás során a petesejt megtermékenyítése nem a petevezetékekben zajlik, hanem a laboratóriumban. Így nincs szükség arra, hogy a petevezetékek megfelelően működjenek, illetve átjárhatók legyenek. Ismert tény, hogy az endometriózis a petevezetékekben hegesedést és súlyos összenövéseket okozhat, ezáltal károsítja annak működését.
Másrészt azért, mert a lombikkezelés során egyszerre több embriót hozunk létre, és a legjobbnak ítélt embriót ültetjük vissza a méhüregbe. Azokat az embriókat, akiket nem ültetünk vissza, mélyfagyasztjuk, így egy későbbi alkalommal fel tudjuk használni őket, és egy sikertelen lombik ciklus után nem kell újra stimulálni a pácienst.
A vizsgálatok során azt találták, hogy bár a lombikkezelés magas ösztrogénszinteket eredményez, ez az ösztrogénhatás csak rövid ideig tart, igy nem kell attól tartani, hogy az endometriózis a kezelés miatt kiújul, vagy rosszabbodik. A tévhittel ellentétben, ha valakinek kis méretű csokoládécisztája van, a lombikkezelés elvégezhető.